Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OIP5O43482 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OIP5O43482 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OIP5O43482 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OIP5O43482 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OIP5O43482 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OIP5O43482 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OIP5O43482 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OIP5O43482 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OIP5O43482 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OIP5O43482 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OIP5O43482 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OIP5O43482 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OIP5O43482 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OIP5O43482 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OIP5O43482 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OIP5O43482 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OIP5O43482 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OIP5O43482 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OIP5O43482 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OIP5O43482 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OIP5O43482 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OIP5O43482 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OIP5O43482 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OIP5O43482 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OIP5O43482 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OIP5O43482 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OIP5O43482 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OIP5O43482 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OIP5O43482 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OIP5O43482 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OIP5O43482 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OIP5O43482 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OIP5O43482 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OIP5O43482 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OIP5O43482 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OIP5O43482 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OIP5O43482 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OIP5O43482 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OIP5O43482 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OIP5O43482 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OIP5O43482 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OIP5O43482 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OIP5O43482 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OIP5O43482 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OIP5O43482 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OIP5O43482 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OIP5O43482 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OIP5O43482 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OIP5O43482 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OIP5O43482 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OIP5O43482 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OIP5O43482 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OIP5O43482 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OIP5O43482 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OIP5O43482 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OIP5O43482 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OIP5O43482 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OIP5O43482 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OIP5O43482 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OIP5O43482 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OIP5O43482 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms