Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DYNC1LI2O43237 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DYNC1LI2O43237 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DYNC1LI2O43237 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms