Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN3O15232 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN3O15232 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN3O15232 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN3O15232 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN3O15232 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN3O15232 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN3O15232 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN3O15232 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN3O15232 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN3O15232 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN3O15232 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MATN3O15232 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MATN3O15232 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MATN3O15232 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN3O15232 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN3O15232 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN3O15232 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN3O15232 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN3O15232 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN3O15232 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN3O15232 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN3O15232 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN3O15232 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN3O15232 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN3O15232 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN3O15232 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN3O15232 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN3O15232 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN3O15232 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN3O15232 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN3O15232 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN3O15232 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN3O15232 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN3O15232 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN3O15232 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN3O15232 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN3O15232 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN3O15232 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN3O15232 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN3O15232 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MATN3O15232 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MATN3O15232 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN3O15232 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN3O15232 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN3O15232 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN3O15232 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN3O15232 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN3O15232 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN3O15232 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN3O15232 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN3O15232 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN3O15232 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN3O15232 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN3O15232 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN3O15232 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN3O15232 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN3O15232 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN3O15232 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN3O15232 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN3O15232 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN3O15232 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN3O15232 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN3O15232 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN3O15232 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN3O15232 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN3O15232 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN3O15232 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN3O15232 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN3O15232 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN3O15232 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN3O15232 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN3O15232 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN3O15232 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MATN3O15232 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MATN3O15232 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MATN3O15232 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MATN3O15232 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MATN3O15232 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MATN3O15232 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN3O15232 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN3O15232 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN3O15232 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN3O15232 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN3O15232 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms