Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1CO15160 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms