Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAMP3O14828 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAMP3O14828 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms