Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP2O14595 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSP2O14595 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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