Protein–RNA interactions for Protein: O14524

NEMP1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1O14524 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMP1O14524 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP1O14524 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP1O14524 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms