Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRPO00591 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRPO00591 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRPO00591 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRPO00591 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRPO00591 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRPO00591 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRPO00591 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRPO00591 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRPO00591 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRPO00591 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRPO00591 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRPO00591 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRPO00591 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRPO00591 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRPO00591 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRPO00591 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRPO00591 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRPO00591 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRPO00591 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRPO00591 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRPO00591 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRPO00591 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRPO00591 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRPO00591 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRPO00591 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRPO00591 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRPO00591 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRPO00591 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRPO00591 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRPO00591 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRPO00591 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRPO00591 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRPO00591 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRPO00591 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRPO00591 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRPO00591 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRPO00591 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRPO00591 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRPO00591 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRPO00591 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRPO00591 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRPO00591 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRPO00591 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRPO00591 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRPO00591 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRPO00591 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRPO00591 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRPO00591 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms