Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN5O00501 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN5O00501 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN5O00501 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN5O00501 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms