Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
O00370 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
O00370 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
O00370 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
O00370 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
O00370 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
O00370 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
O00370 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
O00370 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
O00370 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
O00370 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
O00370 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
O00370 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
O00370 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
O00370 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
O00370 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
O00370 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
O00370 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
O00370 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
O00370 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
O00370 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
O00370 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
O00370 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
O00370 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
O00370 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
O00370 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
O00370 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
O00370 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
O00370 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
O00370 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
O00370 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
O00370 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
O00370 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
O00370 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
O00370 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
O00370 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
O00370 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
O00370 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
O00370 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
O00370 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
O00370 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
O00370 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
O00370 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
O00370 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
O00370 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
O00370 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
O00370 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
O00370 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
O00370 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
O00370 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
O00370 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
O00370 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
O00370 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
O00370 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
O00370 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
O00370 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
O00370 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
O00370 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
O00370 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
O00370 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
O00370 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
O00370 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
O00370 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
O00370 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
O00370 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
O00370 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
O00370 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
O00370 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
O00370 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms