Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIC1O00299 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIC1O00299 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIC1O00299 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms