Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX39AO00148 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDX39AO00148 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX39AO00148 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms