Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QKU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QKU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QKU1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QKU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QKU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QKU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QKU1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QKU1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QKU1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QKU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QKU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QKU1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QKU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QKU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QKU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QKU1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QKU1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QKU1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QKU1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QKU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QKU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QKU1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QKU1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QKU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QKU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QKU1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QKU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QKU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QKU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QKU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QKU1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QKU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QKU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QKU1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QKU1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QKU1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QKU1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QKU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QKU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QKU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QKU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QKU1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QKU1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QKU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QKU1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QKU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QKU1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QKU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QKU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QKU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QKU1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QKU1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QKU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QKU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QKU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QKU1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QKU1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QKU1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QKU1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QKU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QKU1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QKU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QKU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QKU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QKU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QKU1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3QKU1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms