Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC01387J3KSC0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC01387J3KSC0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC01387J3KSC0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms