Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STX16-NPEPL1H3BU86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX16-NPEPL1H3BU86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms