Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BMQ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BMQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BMQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BMQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3BMQ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H3BMQ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H3BMQ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BMQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BMQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BMQ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BMQ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BMQ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3BMQ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BMQ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BMQ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BMQ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BMQ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BMQ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BMQ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BMQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BMQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BMQ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BMQ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BMQ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BMQ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BMQ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BMQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BMQ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BMQ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BMQ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BMQ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BMQ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BMQ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BMQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BMQ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BMQ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BMQ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BMQ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BMQ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BMQ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BMQ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BMQ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BMQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BMQ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BMQ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BMQ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BMQ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BMQ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BMQ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms