Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF26H0Y7S4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF26H0Y7S4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF26H0Y7S4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms