Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F8W8V4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
F8W8V4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8W8V4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8W8V4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8W8V4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8W8V4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8W8V4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8W8V4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8W8V4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8W8V4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8W8V4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8W8V4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8W8V4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8W8V4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8W8V4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8W8V4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8W8V4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8W8V4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
F8W8V4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8W8V4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8W8V4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8W8V4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8W8V4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8W8V4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8W8V4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8W8V4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8W8V4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8W8V4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8W8V4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8W8V4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8W8V4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
F8W8V4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8W8V4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8W8V4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8W8V4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8W8V4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8W8V4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8W8V4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8W8V4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8W8V4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8W8V4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8W8V4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8W8V4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8W8V4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8W8V4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8W8V4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8W8V4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8W8V4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8W8V4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8W8V4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8W8V4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8W8V4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8W8V4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8W8V4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8W8V4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8W8V4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8W8V4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8W8V4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8W8V4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8W8V4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8W8V4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8W8V4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8W8V4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8W8V4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8W8V4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8W8V4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8W8V4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8W8V4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8W8V4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8W8V4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8W8V4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms