Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L5A8MUK1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L5A8MUK1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms