Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YJEFN3A6XGL0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YJEFN3A6XGL0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms