Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NL46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NL46 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NL46 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NL46 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NL46 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NL46 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NL46 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NL46 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NL46 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NL46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NL46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NL46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NL46 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NL46 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NL46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NL46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NL46 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NL46 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NL46 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NL46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A6NL46 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A6NL46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NL46 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NL46 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NL46 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NL46 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NL46 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NL46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NL46 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NL46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NL46 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NL46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NL46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NL46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NL46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NL46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NL46 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NL46 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NL46 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NL46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NL46 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NL46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms