Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD3A6NKT7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD3A6NKT7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RGPD3A6NKT7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RGPD3A6NKT7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms