Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC69A6NI79 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC69A6NI79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms