Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HELTA6NFD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms