Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS37CA5D8V6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37CA5D8V6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37CA5D8V6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms