Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XIRP2A4UGR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XIRP2A4UGR9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XIRP2A4UGR9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms