Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM221AA4D161 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM221AA4D161 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM221AA4D161 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM221AA4D161 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM221AA4D161 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM221AA4D161 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM221AA4D161 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM221AA4D161 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM221AA4D161 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM221AA4D161 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM221AA4D161 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM221AA4D161 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM221AA4D161 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM221AA4D161 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM221AA4D161 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM221AA4D161 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms