Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPED1A4D0V7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CPED1A4D0V7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPED1A4D0V7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms