Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC144AA2RUR9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC144AA2RUR9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CCDC144AA2RUR9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC144AA2RUR9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms