Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIPSLA2A3N6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIPSLA2A3N6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIPSLA2A3N6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms