Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PR48

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PR48 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PR48 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PR48 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PR48 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms