Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A1W2PQD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PQD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1W2PQD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms