Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTC7AQ9ULT0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms