Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX1-2Q9UD57 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms