Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VNN3Q9NY84 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms