Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms