Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms