Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms