Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms