Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms