Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTV1Q96GA3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms