Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFT1Q96AA3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms