Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CAVIN3Q969G5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms