Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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COPS9Q8WXC6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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COPS9Q8WXC6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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COPS9Q8WXC6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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COPS9Q8WXC6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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COPS9Q8WXC6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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COPS9Q8WXC6 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
COPS9Q8WXC6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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