Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF182Q8N6D2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF182Q8N6D2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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