Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME9Q86XW9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME9Q86XW9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms