Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC27A4Q6P1M0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms