Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD40Q6AI12 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms