Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC184Q52MB2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms