Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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